Atualmente os grupos e linhas de pesquisa desenvolvidos nas seções cientificas são:
GRUPO DE PESQUISA: ARBOVÍRUS
Linhas de pesquisa:
- Dengue;
- Encefalites por arbovírus;
- Estudos ultraestruturais de arbovírus;
- Febre amarela;
- Novos arbovírus.
 
GRUPO DE PESQUISA: EPIDEMIOLOGIA DAS ARBOVIROSES EPIDÊMICAS NA AMAZÔNIA BRASILEIRA
Linhas de pesquisa:
- Estudo de epidemias de dengue incluindo dengue hemorrágica;
- Estudo de epidemias de febre amarela;
- Estudo de epidemias de outras arboviroses;
- Estudos da circulação endêmica das arboviroses epidêmicas.
 
GRUPO DE PESQUISA: CLÍNICA DAS FEBRES HEMORRÁGICAS TRANSMITIDAS POR VÍRUS
Linhas de pesquisa:
- Epidemiologia clínica da Febre amarela;
- Epidemiologia clínica do dengue hemorrágico.
 
GRUPO DE PESQUISA: BIOLOGIA MOLECULAR DOS ARBOVÍRUS E VIRUS CAUSADORES DE FEBRES HEMORRÁGICAS
Linhas de pesquisa:
- Caracterização molecular de Flavivírus;
- Caracterização molecular de Hantavírus;
- Caracterização molecular de novos arbovírus isolados na Amazônia Brasileira com taxonomia indefinida;
- Caracterização molecular de Orthobunyavírus;
- Caracterização molecular de Phlebovírus.
 
GRUPO DE PESQUISA: HANTAVÍRUS
Linhas de pesquisa:
- Estudo sorológico das hantaviroses;
- Identificação genética de hantavírus em amostras humanas e de roedores.
 
GRUPO DE PESQUISA: RAIVA
Linhas de pesquisa:
- Caracterização antigênica de amostras de vírus rábico;
- Caracterização genética de isolamentos de raiva;
- Epidemiologia do vírus da raiva na Amazônia brasileira.

GRUPO DE PESQUISA: IMUNOFISIOPATOGÊNESE DE DOENÇAS INFECCIOSAS NA AMAZÔNIA
Linhas de pesquisa:
- Estudos histológicos em primatas não humanos;
-- Imunopatogênese das lesões causadas por agentes infecciosos.

GRUPO DE PESQUISA: DOENÇAS NEGLIGENCIADAS E PESQUISA CLÍNICO-EPIDEMIOLÓGICA APLICADA NA AMAZÔNIA

O grupo idealiza e executa pesquisa clínico operacional, sob perspectiva de pesquisa clínica com repercussões nos três níveis de atenção médico-diagnóstica e vigilância epidemiológica, com ênfase em doenças infecciosas notificáveis compulsoriamente como casos isolados ou em surtos: Doença de Chagas, Hanseníase, Febre tifóide, doenças exantemáticas e outras. Como missão, o grupo realiza pesquisas comprometidas com aplicação imediata de resultados (Pesquisa Translacional), seja na forma de serviço, seja na forma de geração de conhecimento para capacitações de profissionais de saúde na prevenção e controle de algumas das doenças que fazem parte do sistema nacional de vigilância de agravos notificáveis. Também participa ativamente da interlocução com Secretarias Municipais de saúde dos diversos municípios do estado do Pará apoiando ações preventivas e de educação voltadas para populações negligenciadas, com ênfase em ribeirinhos.

 
GRUPO DE PESQUISA: EPIDEMIOLOGIA NA AMAZÔNIA
Linhas de pesquisa:
- Multidisciplinaridade em Pesquisa Epidemiológica.

Ainda no que se refere � pesquisa e tecnologia em sa�de, existe dentro do IEC oInstituto Nacional de Ci�ncia e Tecnologia Para Febres Hemorr�gicas Virais que tem como objetivo o aprofundamento das investiga��es sobre febres hemorr�gicas virais.

A conexão entre as pesquisas realizadas e os diretores da comunidade cientifica e a sociedade é feita pelo Centro de Inovações Tecnológicas do Instituto Evandro Chagas que tem como missão incentivar a inovação e proteção do conhecimento, a geração de produtos, processos e serviços inovadores e o desenvolvimento técnico científico regional e nacional por meio de implementação de projetos de PD&I (Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação).

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